Protein–RNA interactions for Protein: P50446

Krt6a, Keratin, type II cytoskeletal 6A, mousemouse

Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt6aP50446 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt6aP50446 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt6aP50446 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt6aP50446 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt6aP50446 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt6aP50446 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt6aP50446 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt6aP50446 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Krt6aP50446 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt6aP50446 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt6aP50446 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt6aP50446 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt6aP50446 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt6aP50446 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt6aP50446 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt6aP50446 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt6aP50446 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt6aP50446 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Krt6aP50446 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Krt6aP50446 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms