Protein–RNA interactions for Protein: P49817

Cav1, Caveolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cav1P49817 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cav1P49817 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cav1P49817 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cav1P49817 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cav1P49817 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cav1P49817 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cav1P49817 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cav1P49817 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cav1P49817 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cav1P49817 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cav1P49817 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cav1P49817 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cav1P49817 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cav1P49817 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cav1P49817 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cav1P49817 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cav1P49817 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cav1P49817 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cav1P49817 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cav1P49817 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cav1P49817 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cav1P49817 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cav1P49817 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cav1P49817 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cav1P49817 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cav1P49817 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cav1P49817 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cav1P49817 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cav1P49817 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cav1P49817 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cav1P49817 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cav1P49817 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Cav1P49817 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms