Protein–RNA interactions for Protein: P47955

Rplp1, 60S acidic ribosomal protein P1, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rplp1P47955 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Rplp1P47955 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Rplp1P47955 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rplp1P47955 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rplp1P47955 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rplp1P47955 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rplp1P47955 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rplp1P47955 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rplp1P47955 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rplp1P47955 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rplp1P47955 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rplp1P47955 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rplp1P47955 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rplp1P47955 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rplp1P47955 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rplp1P47955 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rplp1P47955 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rplp1P47955 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rplp1P47955 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rplp1P47955 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rplp1P47955 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Rplp1P47955 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rplp1P47955 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rplp1P47955 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rplp1P47955 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rplp1P47955 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rplp1P47955 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rplp1P47955 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Rplp1P47955 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rplp1P47955 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rplp1P47955 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rplp1P47955 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rplp1P47955 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rplp1P47955 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rplp1P47955 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rplp1P47955 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rplp1P47955 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rplp1P47955 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rplp1P47955 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rplp1P47955 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rplp1P47955 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Rplp1P47955 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rplp1P47955 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rplp1P47955 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rplp1P47955 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rplp1P47955 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Rplp1P47955 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rplp1P47955 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rplp1P47955 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Rplp1P47955 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rplp1P47955 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rplp1P47955 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rplp1P47955 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rplp1P47955 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rplp1P47955 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rplp1P47955 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rplp1P47955 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rplp1P47955 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Rplp1P47955 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rplp1P47955 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rplp1P47955 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Rplp1P47955 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Rplp1P47955 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Rplp1P47955 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rplp1P47955 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rplp1P47955 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rplp1P47955 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Rplp1P47955 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rplp1P47955 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rplp1P47955 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rplp1P47955 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Rplp1P47955 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rplp1P47955 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rplp1P47955 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rplp1P47955 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rplp1P47955 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Rplp1P47955 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rplp1P47955 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rplp1P47955 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rplp1P47955 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rplp1P47955 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rplp1P47955 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Rplp1P47955 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Rplp1P47955 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rplp1P47955 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rplp1P47955 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rplp1P47955 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rplp1P47955 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rplp1P47955 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rplp1P47955 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rplp1P47955 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rplp1P47955 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Rplp1P47955 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Rplp1P47955 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rplp1P47955 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rplp1P47955 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rplp1P47955 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rplp1P47955 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Rplp1P47955 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Rplp1P47955 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms