Protein–RNA interactions for Protein: P47915

Rpl29, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl29P47915 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Rpl29P47915 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rpl29P47915 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms