Protein–RNA interactions for Protein: P46096

Syt1, Synaptotagmin-1, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt1P46096 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syt1P46096 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syt1P46096 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syt1P46096 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syt1P46096 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Syt1P46096 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syt1P46096 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syt1P46096 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syt1P46096 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syt1P46096 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syt1P46096 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syt1P46096 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syt1P46096 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syt1P46096 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syt1P46096 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syt1P46096 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syt1P46096 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syt1P46096 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syt1P46096 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syt1P46096 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syt1P46096 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Syt1P46096 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syt1P46096 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syt1P46096 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Syt1P46096 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syt1P46096 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syt1P46096 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syt1P46096 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syt1P46096 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms