Protein–RNA interactions for Protein: P43024

Cox6a1, Cytochrome c oxidase subunit 6A1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cox6a1P43024 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cox6a1P43024 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cox6a1P43024 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cox6a1P43024 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cox6a1P43024 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cox6a1P43024 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cox6a1P43024 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cox6a1P43024 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cox6a1P43024 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cox6a1P43024 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cox6a1P43024 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cox6a1P43024 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cox6a1P43024 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox6a1P43024 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox6a1P43024 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox6a1P43024 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox6a1P43024 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox6a1P43024 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox6a1P43024 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox6a1P43024 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox6a1P43024 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox6a1P43024 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cox6a1P43024 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cox6a1P43024 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cox6a1P43024 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cox6a1P43024 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cox6a1P43024 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cox6a1P43024 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cox6a1P43024 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cox6a1P43024 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms