Protein–RNA interactions for Protein: P40237

Cd82, CD82 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd82P40237 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd82P40237 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cd82P40237 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd82P40237 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd82P40237 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Cd82P40237 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd82P40237 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd82P40237 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd82P40237 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd82P40237 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd82P40237 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd82P40237 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd82P40237 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd82P40237 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd82P40237 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd82P40237 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Cd82P40237 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd82P40237 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd82P40237 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd82P40237 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd82P40237 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd82P40237 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd82P40237 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd82P40237 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd82P40237 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd82P40237 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Cd82P40237 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms