Protein–RNA interactions for Protein: P35279

Rab6a, Ras-related protein Rab-6A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 208 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab6aP35279 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Rab6aP35279 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rab6aP35279 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms