Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Apoc3P33622 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms