Protein–RNA interactions for Protein: P30204

Msr1, Macrophage scavenger receptor types I and II, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msr1P30204 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msr1P30204 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msr1P30204 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msr1P30204 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Msr1P30204 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msr1P30204 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msr1P30204 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msr1P30204 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Msr1P30204 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms