Protein–RNA interactions for Protein: P29788

Vtn, Vitronectin, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VtnP29788 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VtnP29788 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
VtnP29788 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
VtnP29788 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VtnP29788 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VtnP29788 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VtnP29788 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VtnP29788 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VtnP29788 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VtnP29788 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VtnP29788 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VtnP29788 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VtnP29788 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VtnP29788 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VtnP29788 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VtnP29788 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VtnP29788 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VtnP29788 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VtnP29788 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VtnP29788 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VtnP29788 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VtnP29788 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VtnP29788 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VtnP29788 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VtnP29788 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VtnP29788 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
VtnP29788 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VtnP29788 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
VtnP29788 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
VtnP29788 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VtnP29788 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VtnP29788 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
VtnP29788 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VtnP29788 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VtnP29788 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VtnP29788 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VtnP29788 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VtnP29788 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VtnP29788 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
VtnP29788 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VtnP29788 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VtnP29788 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
VtnP29788 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
VtnP29788 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VtnP29788 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VtnP29788 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VtnP29788 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VtnP29788 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VtnP29788 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VtnP29788 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VtnP29788 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
VtnP29788 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VtnP29788 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VtnP29788 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VtnP29788 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
VtnP29788 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VtnP29788 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
VtnP29788 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VtnP29788 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VtnP29788 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VtnP29788 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VtnP29788 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VtnP29788 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VtnP29788 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
VtnP29788 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
VtnP29788 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
VtnP29788 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VtnP29788 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VtnP29788 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
VtnP29788 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
VtnP29788 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
VtnP29788 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
VtnP29788 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
VtnP29788 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VtnP29788 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VtnP29788 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VtnP29788 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
VtnP29788 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
VtnP29788 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VtnP29788 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VtnP29788 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VtnP29788 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VtnP29788 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VtnP29788 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VtnP29788 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VtnP29788 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VtnP29788 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VtnP29788 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VtnP29788 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
VtnP29788 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VtnP29788 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
VtnP29788 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
VtnP29788 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
VtnP29788 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VtnP29788 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
VtnP29788 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VtnP29788 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
VtnP29788 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VtnP29788 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
VtnP29788 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms