Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Casp1P29452 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Casp1P29452 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Casp1P29452 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Casp1P29452 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Casp1P29452 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Casp1P29452 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Casp1P29452 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Casp1P29452 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Casp1P29452 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Casp1P29452 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Casp1P29452 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Casp1P29452 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Casp1P29452 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Casp1P29452 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casp1P29452 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Casp1P29452 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Casp1P29452 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Casp1P29452 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Casp1P29452 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Casp1P29452 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Casp1P29452 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Casp1P29452 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Casp1P29452 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Casp1P29452 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms