Protein–RNA interactions for Protein: P28700

Rxra, Retinoic acid receptor RXR-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RxraP28700 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RxraP28700 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RxraP28700 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RxraP28700 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RxraP28700 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RxraP28700 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RxraP28700 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RxraP28700 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
RxraP28700 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
RxraP28700 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RxraP28700 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RxraP28700 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RxraP28700 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RxraP28700 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RxraP28700 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
RxraP28700 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RxraP28700 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RxraP28700 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RxraP28700 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RxraP28700 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RxraP28700 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RxraP28700 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
RxraP28700 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
RxraP28700 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RxraP28700 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RxraP28700 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RxraP28700 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RxraP28700 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RxraP28700 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RxraP28700 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
RxraP28700 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
RxraP28700 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RxraP28700 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
RxraP28700 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RxraP28700 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RxraP28700 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RxraP28700 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RxraP28700 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
RxraP28700 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RxraP28700 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RxraP28700 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RxraP28700 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RxraP28700 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
RxraP28700 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RxraP28700 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RxraP28700 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RxraP28700 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RxraP28700 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RxraP28700 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RxraP28700 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RxraP28700 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
RxraP28700 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
RxraP28700 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RxraP28700 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
RxraP28700 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RxraP28700 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RxraP28700 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RxraP28700 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
RxraP28700 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RxraP28700 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RxraP28700 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RxraP28700 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RxraP28700 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RxraP28700 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
RxraP28700 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RxraP28700 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
RxraP28700 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RxraP28700 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RxraP28700 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RxraP28700 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RxraP28700 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RxraP28700 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RxraP28700 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RxraP28700 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
RxraP28700 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RxraP28700 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RxraP28700 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RxraP28700 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RxraP28700 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RxraP28700 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RxraP28700 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RxraP28700 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RxraP28700 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RxraP28700 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RxraP28700 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RxraP28700 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RxraP28700 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RxraP28700 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RxraP28700 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RxraP28700 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RxraP28700 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RxraP28700 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RxraP28700 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RxraP28700 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RxraP28700 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
RxraP28700 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RxraP28700 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RxraP28700 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
RxraP28700 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RxraP28700 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms