Protein–RNA interactions for Protein: P28322

Etv4, ETS translocation variant 4, mousemouse

Predictions only

Length 485 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv4P28322 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Etv4P28322 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Etv4P28322 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Etv4P28322 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Etv4P28322 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Etv4P28322 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Etv4P28322 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Etv4P28322 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms