Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Gjb3P28231 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gjb3P28231 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gjb3P28231 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gjb3P28231 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Gjb3P28231 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Gjb3P28231 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Gjb3P28231 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms