Protein–RNA interactions for Protein: P26048

Gabra2, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gabra2P26048 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra2P26048 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra2P26048 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra2P26048 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra2P26048 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra2P26048 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra2P26048 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra2P26048 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra2P26048 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra2P26048 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra2P26048 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gabra2P26048 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra2P26048 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra2P26048 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra2P26048 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra2P26048 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra2P26048 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra2P26048 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra2P26048 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra2P26048 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra2P26048 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra2P26048 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra2P26048 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra2P26048 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra2P26048 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra2P26048 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra2P26048 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra2P26048 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra2P26048 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gabra2P26048 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gabra2P26048 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gabra2P26048 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Gabra2P26048 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gabra2P26048 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gabra2P26048 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gabra2P26048 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gabra2P26048 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gabra2P26048 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gabra2P26048 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.9 ms