Protein–RNA interactions for Protein: P20181

Ntf3, Neurotrophin-3, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntf3P20181 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ntf3P20181 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.21■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
Ntf3P20181 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms