Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rpl13aP19253 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms