Protein–RNA interactions for Protein: P18828

Sdc1, Syndecan-1, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc1P18828 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sdc1P18828 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms