Protein–RNA interactions for Protein: P18527

Ig heavy chain V region 914, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P18527 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
P18527 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P18527 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18527 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18527 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18527 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18527 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18527 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18527 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18527 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P18527 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18527 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18527 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18527 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
P18527 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
P18527 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18527 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18527 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18527 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18527 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18527 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18527 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18527 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18527 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18527 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18527 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18527 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18527 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P18527 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18527 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
P18527 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18527 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18527 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18527 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
P18527 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18527 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18527 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18527 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18527 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18527 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18527 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18527 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
P18527 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18527 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18527 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18527 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18527 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18527 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18527 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18527 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
P18527 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18527 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18527 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18527 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18527 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18527 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18527 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
P18527 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18527 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18527 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18527 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18527 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18527 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18527 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18527 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18527 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
P18527 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18527 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18527 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18527 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18527 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18527 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18527 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18527 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18527 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18527 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18527 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18527 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18527 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
P18527 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18527 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18527 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18527 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18527 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18527 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18527 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18527 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18527 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18527 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
P18527 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18527 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18527 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18527 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18527 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18527 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18527 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18527 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18527 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18527 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
P18527 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms