Protein–RNA interactions for Protein: P16054

Prkce, Protein kinase C epsilon type, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkceP16054 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
PrkceP16054 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrkceP16054 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrkceP16054 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrkceP16054 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrkceP16054 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrkceP16054 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrkceP16054 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrkceP16054 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrkceP16054 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrkceP16054 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrkceP16054 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrkceP16054 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrkceP16054 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
PrkceP16054 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkceP16054 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkceP16054 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkceP16054 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkceP16054 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkceP16054 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkceP16054 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
PrkceP16054 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkceP16054 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkceP16054 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkceP16054 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkceP16054 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkceP16054 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkceP16054 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkceP16054 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkceP16054 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkceP16054 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkceP16054 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkceP16054 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkceP16054 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkceP16054 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkceP16054 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkceP16054 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkceP16054 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
PrkceP16054 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkceP16054 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkceP16054 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkceP16054 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkceP16054 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkceP16054 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkceP16054 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
PrkceP16054 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkceP16054 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkceP16054 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkceP16054 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkceP16054 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkceP16054 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkceP16054 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkceP16054 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkceP16054 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkceP16054 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkceP16054 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkceP16054 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkceP16054 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkceP16054 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkceP16054 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkceP16054 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
PrkceP16054 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkceP16054 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkceP16054 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkceP16054 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkceP16054 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkceP16054 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkceP16054 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkceP16054 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkceP16054 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkceP16054 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkceP16054 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkceP16054 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkceP16054 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
PrkceP16054 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
PrkceP16054 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkceP16054 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkceP16054 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
PrkceP16054 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms