Protein–RNA interactions for Protein: P14431

H2-Q9, H-2 class I histocompatibility antigen, Q9 alpha chain (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Q9P14431 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-Q9P14431 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-Q9P14431 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-Q9P14431 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-Q9P14431 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-Q9P14431 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-Q9P14431 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-Q9P14431 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-Q9P14431 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-Q9P14431 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-Q9P14431 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
H2-Q9P14431 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
H2-Q9P14431 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
H2-Q9P14431 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms