Protein–RNA interactions for Protein: P12850

Cxcl1, Growth-regulated alpha protein, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl1P12850 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cxcl1P12850 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cxcl1P12850 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms