Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fv4P11370 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fv4P11370 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fv4P11370 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fv4P11370 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Fv4P11370 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fv4P11370 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fv4P11370 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fv4P11370 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fv4P11370 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fv4P11370 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fv4P11370 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Fv4P11370 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms