Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC7.48□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Pcdhga12-201ENSMUST00000044851 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Tnrc6c-201ENSMUST00000026658 8724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC7.47□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.47□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC7.46□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC7.46□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Larp4b-202ENSMUST00000188211 5610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.21
Tnp1P10856 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Tnp1P10856 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Tnp1P10856 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.46□□□□□ -1.22
Tnp1P10856 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.46□□□□□ -1.22
Tnp1P10856 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC7.46□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms