Protein–RNA interactions for Protein: P10300

Cd8b, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 213 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd8bP10300 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd8bP10300 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Cd8bP10300 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd8bP10300 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd8bP10300 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd8bP10300 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd8bP10300 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd8bP10300 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd8bP10300 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd8bP10300 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd8bP10300 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd8bP10300 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd8bP10300 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd8bP10300 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd8bP10300 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd8bP10300 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd8bP10300 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd8bP10300 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd8bP10300 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd8bP10300 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Cd8bP10300 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd8bP10300 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd8bP10300 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd8bP10300 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd8bP10300 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd8bP10300 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd8bP10300 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd8bP10300 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd8bP10300 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd8bP10300 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd8bP10300 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd8bP10300 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd8bP10300 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd8bP10300 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd8bP10300 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd8bP10300 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd8bP10300 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd8bP10300 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd8bP10300 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd8bP10300 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd8bP10300 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Cd8bP10300 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd8bP10300 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Cd8bP10300 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd8bP10300 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd8bP10300 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd8bP10300 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd8bP10300 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd8bP10300 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd8bP10300 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd8bP10300 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd8bP10300 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd8bP10300 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd8bP10300 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd8bP10300 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Cd8bP10300 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd8bP10300 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd8bP10300 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd8bP10300 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd8bP10300 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd8bP10300 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd8bP10300 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd8bP10300 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd8bP10300 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd8bP10300 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd8bP10300 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd8bP10300 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd8bP10300 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd8bP10300 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd8bP10300 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd8bP10300 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd8bP10300 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd8bP10300 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd8bP10300 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd8bP10300 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Cd8bP10300 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd8bP10300 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd8bP10300 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd8bP10300 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd8bP10300 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd8bP10300 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd8bP10300 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd8bP10300 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd8bP10300 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd8bP10300 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd8bP10300 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd8bP10300 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Cd8bP10300 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd8bP10300 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd8bP10300 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd8bP10300 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd8bP10300 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd8bP10300 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd8bP10300 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd8bP10300 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd8bP10300 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd8bP10300 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd8bP10300 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd8bP10300 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Cd8bP10300 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms