Protein–RNA interactions for Protein: P10148

Ccl2, C-C motif chemokine 2, mousemouse

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Length 148 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl2P10148 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl2P10148 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl2P10148 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl2P10148 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl2P10148 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl2P10148 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl2P10148 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl2P10148 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl2P10148 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl2P10148 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl2P10148 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl2P10148 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl2P10148 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl2P10148 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl2P10148 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl2P10148 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl2P10148 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl2P10148 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Ccl2P10148 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl2P10148 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl2P10148 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl2P10148 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl2P10148 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl2P10148 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Ccl2P10148 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl2P10148 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Ccl2P10148 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccl2P10148 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccl2P10148 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccl2P10148 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccl2P10148 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Ccl2P10148 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl2P10148 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl2P10148 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl2P10148 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl2P10148 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl2P10148 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl2P10148 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ccl2P10148 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Ccl2P10148 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl2P10148 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Ccl2P10148 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccl2P10148 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccl2P10148 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Ccl2P10148 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Ccl2P10148 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Ccl2P10148 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccl2P10148 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Ccl2P10148 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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Ccl2P10148 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccl2P10148 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccl2P10148 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccl2P10148 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccl2P10148 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccl2P10148 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccl2P10148 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccl2P10148 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccl2P10148 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccl2P10148 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Ccl2P10148 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccl2P10148 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccl2P10148 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccl2P10148 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccl2P10148 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccl2P10148 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccl2P10148 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Ccl2P10148 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.7 ms