Protein–RNA interactions for Protein: P07350

Ifna6, Interferon alpha-6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna6P07350 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna6P07350 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna6P07350 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna6P07350 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna6P07350 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna6P07350 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna6P07350 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna6P07350 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna6P07350 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna6P07350 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna6P07350 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna6P07350 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ifna6P07350 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifna6P07350 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifna6P07350 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifna6P07350 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifna6P07350 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifna6P07350 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ifna6P07350 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna6P07350 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna6P07350 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ifna6P07350 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna6P07350 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ifna6P07350 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna6P07350 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna6P07350 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna6P07350 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna6P07350 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna6P07350 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna6P07350 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna6P07350 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna6P07350 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna6P07350 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna6P07350 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna6P07350 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna6P07350 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna6P07350 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna6P07350 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna6P07350 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ifna6P07350 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna6P07350 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna6P07350 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna6P07350 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna6P07350 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna6P07350 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna6P07350 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna6P07350 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna6P07350 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna6P07350 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna6P07350 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna6P07350 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna6P07350 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna6P07350 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna6P07350 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna6P07350 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna6P07350 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna6P07350 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna6P07350 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna6P07350 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna6P07350 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ifna6P07350 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna6P07350 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna6P07350 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna6P07350 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna6P07350 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna6P07350 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna6P07350 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna6P07350 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna6P07350 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna6P07350 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna6P07350 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna6P07350 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna6P07350 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna6P07350 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna6P07350 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna6P07350 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna6P07350 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna6P07350 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna6P07350 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna6P07350 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna6P07350 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna6P07350 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna6P07350 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna6P07350 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna6P07350 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna6P07350 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna6P07350 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna6P07350 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ifna6P07350 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ifna6P07350 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ifna6P07350 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ifna6P07350 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ifna6P07350 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ifna6P07350 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ifna6P07350 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifna6P07350 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifna6P07350 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Ifna6P07350 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifna6P07350 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ifna6P07350 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.7 ms