Protein–RNA interactions for Protein: P06798

Hoxa4, Homeobox protein Hox-A4, mousemouse

Predictions only

Length 285 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxa4P06798 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Hoxa4P06798 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Hoxa4P06798 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms