Protein–RNA interactions for Protein: P06728

Apoa4, Apolipoprotein A-IV, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoa4P06728 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Apoa4P06728 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Apoa4P06728 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms