Protein–RNA interactions for Protein: P05555

Itgam, Integrin alpha-M, mousemouse

Predictions only

Length 1,153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgamP05555 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ItgamP05555 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ItgamP05555 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ItgamP05555 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ItgamP05555 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ItgamP05555 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ItgamP05555 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ItgamP05555 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ItgamP05555 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ItgamP05555 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ItgamP05555 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ItgamP05555 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ItgamP05555 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ItgamP05555 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ItgamP05555 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ItgamP05555 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ItgamP05555 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ItgamP05555 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ItgamP05555 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
ItgamP05555 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ItgamP05555 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ItgamP05555 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ItgamP05555 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ItgamP05555 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ItgamP05555 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ItgamP05555 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms