Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
H2-Eb1P04230 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
H2-Eb1P04230 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms