Protein–RNA interactions for Protein: O88875

Cd160, CD160 antigen, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd160O88875 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd160O88875 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd160O88875 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd160O88875 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd160O88875 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cd160O88875 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd160O88875 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd160O88875 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd160O88875 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd160O88875 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd160O88875 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd160O88875 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd160O88875 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd160O88875 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd160O88875 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd160O88875 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd160O88875 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd160O88875 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd160O88875 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd160O88875 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd160O88875 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd160O88875 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd160O88875 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd160O88875 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd160O88875 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cd160O88875 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cd160O88875 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cd160O88875 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
Cd160O88875 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cd160O88875 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cd160O88875 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cd160O88875 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Anks1b-225ENSMUST00000182966 1625 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd160O88875 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd160O88875 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd160O88875 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd160O88875 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Cd160O88875 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms