Protein–RNA interactions for Protein: O88824

Jtb, Protein JTB, mousemouse

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JtbO88824 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
JtbO88824 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
JtbO88824 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
JtbO88824 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
JtbO88824 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
JtbO88824 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
JtbO88824 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
JtbO88824 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
JtbO88824 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
JtbO88824 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
JtbO88824 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
JtbO88824 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
JtbO88824 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
JtbO88824 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
JtbO88824 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
JtbO88824 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
JtbO88824 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
JtbO88824 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
JtbO88824 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
JtbO88824 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JtbO88824 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JtbO88824 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JtbO88824 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JtbO88824 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JtbO88824 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JtbO88824 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JtbO88824 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
JtbO88824 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
JtbO88824 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JtbO88824 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JtbO88824 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JtbO88824 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JtbO88824 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
JtbO88824 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
JtbO88824 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
JtbO88824 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
JtbO88824 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
JtbO88824 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
JtbO88824 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
JtbO88824 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
JtbO88824 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JtbO88824 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JtbO88824 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JtbO88824 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
JtbO88824 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JtbO88824 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
JtbO88824 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
JtbO88824 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JtbO88824 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JtbO88824 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
JtbO88824 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
JtbO88824 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JtbO88824 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JtbO88824 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JtbO88824 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
JtbO88824 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
JtbO88824 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JtbO88824 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
JtbO88824 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JtbO88824 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JtbO88824 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JtbO88824 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
JtbO88824 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JtbO88824 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
JtbO88824 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
JtbO88824 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JtbO88824 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
JtbO88824 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JtbO88824 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JtbO88824 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JtbO88824 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JtbO88824 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JtbO88824 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
JtbO88824 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JtbO88824 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JtbO88824 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JtbO88824 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JtbO88824 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JtbO88824 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JtbO88824 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JtbO88824 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
JtbO88824 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JtbO88824 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JtbO88824 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JtbO88824 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JtbO88824 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JtbO88824 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JtbO88824 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JtbO88824 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JtbO88824 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
JtbO88824 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JtbO88824 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JtbO88824 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
JtbO88824 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
JtbO88824 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JtbO88824 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JtbO88824 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JtbO88824 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
JtbO88824 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
JtbO88824 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms