Protein–RNA interactions for Protein: O88445

Aurkc, Aurora kinase C, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AurkcO88445 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
AurkcO88445 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
AurkcO88445 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
AurkcO88445 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
AurkcO88445 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
AurkcO88445 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AurkcO88445 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AurkcO88445 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
AurkcO88445 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
AurkcO88445 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
AurkcO88445 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms