Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Itgb5O70309 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Itgb5O70309 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms