Protein–RNA interactions for Protein: O70157

Top3a, DNA topoisomerase 3-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 1,003 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top3aO70157 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Top3aO70157 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top3aO70157 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top3aO70157 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top3aO70157 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top3aO70157 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top3aO70157 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top3aO70157 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top3aO70157 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top3aO70157 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top3aO70157 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top3aO70157 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top3aO70157 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Top3aO70157 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top3aO70157 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top3aO70157 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top3aO70157 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top3aO70157 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top3aO70157 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top3aO70157 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top3aO70157 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top3aO70157 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top3aO70157 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top3aO70157 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top3aO70157 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top3aO70157 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top3aO70157 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top3aO70157 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top3aO70157 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top3aO70157 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top3aO70157 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Top3aO70157 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top3aO70157 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top3aO70157 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top3aO70157 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top3aO70157 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Top3aO70157 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top3aO70157 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top3aO70157 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top3aO70157 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top3aO70157 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top3aO70157 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top3aO70157 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
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Top3aO70157 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Top3aO70157 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top3aO70157 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Top3aO70157 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top3aO70157 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top3aO70157 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top3aO70157 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top3aO70157 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top3aO70157 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Top3aO70157 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top3aO70157 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top3aO70157 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Top3aO70157 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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Top3aO70157 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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Top3aO70157 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top3aO70157 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Top3aO70157 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top3aO70157 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top3aO70157 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top3aO70157 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top3aO70157 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Top3aO70157 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top3aO70157 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top3aO70157 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Top3aO70157 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Top3aO70157 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
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