Protein–RNA interactions for Protein: O60911

CTSV, Cathepsin L2, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSVO60911 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTSVO60911 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTSVO60911 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CTSVO60911 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTSVO60911 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTSVO60911 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTSVO60911 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTSVO60911 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTSVO60911 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTSVO60911 GGTLC1-202ENST00000286890 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTSVO60911 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTSVO60911 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTSVO60911 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTSVO60911 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTSVO60911 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTSVO60911 COL8A2-203ENST00000481785 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTSVO60911 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTSVO60911 MDFI-203ENST00000373051 1622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTSVO60911 AVPI1-201ENST00000370626 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTSVO60911 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CTSVO60911 KLHL17-205ENST00000622660 1950 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTSVO60911 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTSVO60911 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTSVO60911 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTSVO60911 ARL6IP4-205ENST00000412505 818 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTSVO60911 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTSVO60911 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTSVO60911 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CTSVO60911 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTSVO60911 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTSVO60911 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTSVO60911 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTSVO60911 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTSVO60911 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTSVO60911 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTSVO60911 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTSVO60911 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTSVO60911 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTSVO60911 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CTSVO60911 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTSVO60911 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTSVO60911 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTSVO60911 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTSVO60911 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTSVO60911 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTSVO60911 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTSVO60911 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CTSVO60911 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTSVO60911 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTSVO60911 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTSVO60911 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTSVO60911 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTSVO60911 DHRS4-202ENST00000397074 785 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTSVO60911 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CTSVO60911 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CTSVO60911 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTSVO60911 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTSVO60911 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTSVO60911 SPR-201ENST00000234454 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTSVO60911 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTSVO60911 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
CTSVO60911 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CTSVO60911 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
CTSVO60911 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
CTSVO60911 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTSVO60911 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CTSVO60911 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTSVO60911 TTYH1-201ENST00000301194 2088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTSVO60911 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTSVO60911 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTSVO60911 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTSVO60911 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTSVO60911 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTSVO60911 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTSVO60911 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTSVO60911 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTSVO60911 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTSVO60911 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTSVO60911 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CTSVO60911 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTSVO60911 PTOV1-212ENST00000599732 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTSVO60911 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CTSVO60911 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTSVO60911 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTSVO60911 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
CTSVO60911 KHDC3L-201ENST00000370367 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTSVO60911 KANSL1-AS1-201ENST00000398275 517 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTSVO60911 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
CTSVO60911 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CTSVO60911 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
CTSVO60911 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTSVO60911 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTSVO60911 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CTSVO60911 PPP1R12B-212ENST00000480184 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTSVO60911 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTSVO60911 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTSVO60911 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTSVO60911 FASTK-217ENST00000540185 1609 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTSVO60911 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CTSVO60911 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms