Protein–RNA interactions for Protein: O55187

Cbx4, E3 SUMO-protein ligase CBX4, mousemouse

Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cbx4O55187 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Cbx4O55187 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cbx4O55187 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.8 ms