Protein–RNA interactions for Protein: O55042

Snca, Alpha-synuclein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncaO55042 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SncaO55042 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SncaO55042 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SncaO55042 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SncaO55042 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SncaO55042 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SncaO55042 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SncaO55042 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SncaO55042 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SncaO55042 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SncaO55042 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SncaO55042 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SncaO55042 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SncaO55042 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SncaO55042 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SncaO55042 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SncaO55042 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SncaO55042 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SncaO55042 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SncaO55042 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SncaO55042 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SncaO55042 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SncaO55042 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SncaO55042 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SncaO55042 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SncaO55042 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SncaO55042 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SncaO55042 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
SncaO55042 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SncaO55042 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SncaO55042 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SncaO55042 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SncaO55042 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
SncaO55042 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
SncaO55042 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SncaO55042 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SncaO55042 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SncaO55042 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SncaO55042 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SncaO55042 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SncaO55042 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SncaO55042 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SncaO55042 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SncaO55042 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SncaO55042 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
SncaO55042 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SncaO55042 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SncaO55042 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
SncaO55042 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SncaO55042 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SncaO55042 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
SncaO55042 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SncaO55042 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SncaO55042 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SncaO55042 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SncaO55042 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SncaO55042 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SncaO55042 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SncaO55042 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SncaO55042 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SncaO55042 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SncaO55042 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SncaO55042 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SncaO55042 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
SncaO55042 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SncaO55042 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SncaO55042 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SncaO55042 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SncaO55042 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SncaO55042 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
SncaO55042 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SncaO55042 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
SncaO55042 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncaO55042 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncaO55042 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncaO55042 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncaO55042 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
SncaO55042 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncaO55042 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncaO55042 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncaO55042 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncaO55042 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncaO55042 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncaO55042 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncaO55042 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncaO55042 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncaO55042 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncaO55042 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncaO55042 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncaO55042 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncaO55042 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncaO55042 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncaO55042 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncaO55042 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
SncaO55042 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SncaO55042 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SncaO55042 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SncaO55042 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SncaO55042 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
SncaO55042 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms