Protein–RNA interactions for Protein: O54956

Pole2, DNA polymerase epsilon subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 527 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole2O54956 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pole2O54956 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pole2O54956 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pole2O54956 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Pole2O54956 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pole2O54956 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pole2O54956 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Pole2O54956 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms