Protein–RNA interactions for Protein: O54909

Rdh16, Cis-retinol androgen dehydrogenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16O54909 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh16O54909 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh16O54909 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh16O54909 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh16O54909 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh16O54909 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh16O54909 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh16O54909 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh16O54909 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh16O54909 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh16O54909 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rdh16O54909 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rdh16O54909 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms