Protein–RNA interactions for Protein: O35963

Rab33b, Ras-related protein Rab-33B, mousemouse

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab33bO35963 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab33bO35963 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab33bO35963 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms