Protein–RNA interactions for Protein: O35927

Ctnnd2, Catenin delta-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,247 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnd2O35927 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ctnnd2O35927 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ctnnd2O35927 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnnd2O35927 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnnd2O35927 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnnd2O35927 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnnd2O35927 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnnd2O35927 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnnd2O35927 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnnd2O35927 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnnd2O35927 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnnd2O35927 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnnd2O35927 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnnd2O35927 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ctnnd2O35927 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnd2O35927 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnd2O35927 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnd2O35927 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnd2O35927 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnd2O35927 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnd2O35927 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnd2O35927 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnd2O35927 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnd2O35927 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnd2O35927 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnd2O35927 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ctnnd2O35927 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.8 ms