Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Cited2O35740 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cited2O35740 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cited2O35740 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Cited2O35740 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cited2O35740 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Cited2O35740 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cited2O35740 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cited2O35740 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cited2O35740 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cited2O35740 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cited2O35740 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cited2O35740 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cited2O35740 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cited2O35740 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cited2O35740 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cited2O35740 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Cited2O35740 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cited2O35740 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cited2O35740 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cited2O35740 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cited2O35740 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cited2O35740 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cited2O35740 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cited2O35740 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cited2O35740 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cited2O35740 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Cited2O35740 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cited2O35740 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cited2O35740 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cited2O35740 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cited2O35740 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cited2O35740 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cited2O35740 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cited2O35740 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cited2O35740 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cited2O35740 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cited2O35740 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cited2O35740 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cited2O35740 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Cited2O35740 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cited2O35740 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Cited2O35740 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
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