Protein–RNA interactions for Protein: O35347

Dgcr6, Protein DGCR6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dgcr6O35347 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dgcr6O35347 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dgcr6O35347 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dgcr6O35347 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Dgcr6O35347 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dgcr6O35347 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Dgcr6O35347 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dgcr6O35347 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dgcr6O35347 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dgcr6O35347 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dgcr6O35347 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dgcr6O35347 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dgcr6O35347 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dgcr6O35347 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Dgcr6O35347 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Dgcr6O35347 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dgcr6O35347 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dgcr6O35347 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dgcr6O35347 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dgcr6O35347 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Dgcr6O35347 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dgcr6O35347 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dgcr6O35347 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dgcr6O35347 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dgcr6O35347 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dgcr6O35347 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dgcr6O35347 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dgcr6O35347 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dgcr6O35347 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dgcr6O35347 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dgcr6O35347 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Dgcr6O35347 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dgcr6O35347 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Dgcr6O35347 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dgcr6O35347 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dgcr6O35347 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dgcr6O35347 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dgcr6O35347 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dgcr6O35347 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dgcr6O35347 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dgcr6O35347 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dgcr6O35347 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dgcr6O35347 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dgcr6O35347 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dgcr6O35347 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dgcr6O35347 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dgcr6O35347 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dgcr6O35347 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dgcr6O35347 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dgcr6O35347 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dgcr6O35347 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dgcr6O35347 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dgcr6O35347 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dgcr6O35347 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dgcr6O35347 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dgcr6O35347 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dgcr6O35347 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dgcr6O35347 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dgcr6O35347 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms