Protein–RNA interactions for Protein: O35118

Gfra3, GDNF family receptor alpha-3, mousemouse

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfra3O35118 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Gm42790-201ENSMUST00000201268 969 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gfra3O35118 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms