Protein–RNA interactions for Protein: O08795

Prkcsh, Glucosidase 2 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkcshO08795 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkcshO08795 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkcshO08795 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkcshO08795 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkcshO08795 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkcshO08795 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkcshO08795 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkcshO08795 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkcshO08795 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PrkcshO08795 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkcshO08795 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkcshO08795 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkcshO08795 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkcshO08795 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkcshO08795 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkcshO08795 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkcshO08795 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkcshO08795 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkcshO08795 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkcshO08795 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PrkcshO08795 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkcshO08795 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkcshO08795 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkcshO08795 Ddit4-201ENSMUST00000020308 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkcshO08795 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkcshO08795 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkcshO08795 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkcshO08795 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkcshO08795 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PrkcshO08795 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkcshO08795 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkcshO08795 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkcshO08795 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkcshO08795 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkcshO08795 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkcshO08795 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkcshO08795 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkcshO08795 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkcshO08795 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PrkcshO08795 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PrkcshO08795 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PrkcshO08795 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PrkcshO08795 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PrkcshO08795 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Cep170-205ENSMUST00000192961 2708 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Slc46a3-201ENSMUST00000031655 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PrkcshO08795 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.9 ms