Protein–RNA interactions for Protein: O08574

Mesp2, Mesoderm posterior protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mesp2O08574 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mesp2O08574 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Mesp2O08574 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms