Protein–RNA interactions for Protein: J3QPP2

Gm3685, Predicted gene 3685, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3685J3QPP2 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm3685J3QPP2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Gm3685J3QPP2 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms